Юрий Бойко родился 9 октября 1958 года в Горловке (Донецкая обл.). С 1999 по 2001 гг. был генеральным директором АО "Лисичанскнефтеоргсинтез" (Лисичанский НПЗ), с августа 2001 по февраль 2002 гг. – председатель правления ЗАО "Укртатнафта" (Кременчугский НПЗ). С июля 2003 по март 2005 гг. – первый заместитель министра топлива и энергетики – председатель правления НАК "Нафтогаз Украины". С 4 августа 2006 года – министр топлива и энергетики Украины.
23 октября кандидат в народные депутаты от Партии регионов Юрий Мирошниченко сообщил, что Юрий Бойко был включен в ряды Партии Регионов.